JONAの認証は、会員・非会員のいずれでも申請することができます。

入会金
NPO法人JONAの会員になるための費用で、1年目のみ発生します。団体と個人で費用が異なります(個人とは、家族経営の農家に限られるのでご注意ください)。
年会費
NPO法人の年会費(毎年1回)。
システム利用料
JONAの認証情報および会員管理システムの利用料。非会員の初年度認証時に請求します。
認証業務費
非会員には、毎年、申請ごとに発生します。
認証申請料
会員・準会員・非会員とも、業態1件(認証書1枚)あたり団体2万円、個人1万円となります。申請時に発生します。
検査費用
検査費用は、検査日当、書類審査費、レポート作成費のほか、検査員の旅費(実費)で構成されます。なお、検査日当は、日数で算出しますので、圃場の枚数、面積等で変動することはありません。
臨時確認調査手数料
人員または施設の変更、品目の追加など認証内容の変更に際し、臨時に調査が必要な場合に発生する費用です。
運営協力費
JONAの名称使用料。(JONAの名称、認証コード番号等を使用した商品の売上に対し一 律0.4 % ) 上限は45万円/年。  売上報告は3か月ごとの有機の売り上げ合計額を提出願います。